Lai savienotu vairākus CT trīsfāžu sistēmā, ir nepieciešama sistemātiska uzmanība fāzes identifikācijai, polaritātei un pievienotā aprīkojuma īpašajām prasībām. Trīsfāzu sistēmas var konfigurēt kā 3 fāžu 4 vadu Wye, 3 fāžu 3 vadu tiešo savienojumu vai 3 fāžu 3 vadu atvērto trīsstūri, un CT savienojuma izkārtojums ir atkarīgs no sistēmas konfigurācijas.
Standarta trīs{0}fāžu sistēmā katram fāzes vadītājam-L1, L2 un L3 ir uzstādīts viens CT. CT bieži tiek apzīmēti kā CT1, CT2 un CT3. Katram CT primārā puse ir savienota virknē ar atbilstošo fāzes vadu, un tā sekundārā puse ir savienota ar mērīšanas vai aizsardzības aprīkojumu.
Enerģijas mērīšanai S1 vads no katra CT savienojas ar atbilstošo skaitītāja strāvas ievades spaili. S2 vadi no visiem trim CT parasti ir savienoti kopā un iezemēti vienā punktā. S1 vadītājs (bieži balts) tiek savienots ar ievades spaili, un S2 vadītājs (bieži vien melns) tiek savienots ar blakus esošo spaili katrai fāzei. Ir svarīgi, lai CT uzraudzība katrai fāzei tiktu saskaņota ar sprieguma ievadi no tās pašas fāzes. CT1 jāuzrauga tā pati fāze kā spriegumam, kas pievienots skaitītājam uz L1, CT2 jāuzrauga tā pati fāze kā L2, un CT3 jāuzrauga tā pati fāze kā L3-.
Aizsardzības relejiem savienojuma izkārtojums var būt sarežģītāks. Transformatora diferenciālajā aizsardzībā CT savienojumiem ir jāņem vērā fāzes nobīde starp strāvas transformatora primāro un sekundāro pusi. Ja transformatora primārais tinums ir pieslēgts delta-, primārie CT ir savienoti ar zvaigznīti; ja transformatora sekundārais tinums ir savienots ar zvaigznīti, sekundārie CT ir savienoti trīsstūrī. Tas kompensē 30 grādu fāzes nobīdi un nodrošina, ka strāvas, kas nonāk relejā, normālos apstākļos ir fāzē.
Aizsardzība pret zemējuma defektiem trīsfāžu sistēmās var izmantot īpašu nulles-secības CT, kas uzstādīta ap visiem trim fāzu vadītājiem. Šajā konfigurācijā CT nosaka atlikušo strāvu, kas plūst tikai tad, kad notiek zemējuma defekts. Aizsardzības lietojumos, kur CT ir pievienots zemējuma noplūdes relejam, neitrālais vads un visi strāvu vadi ir jāizlaiž caur CT apertūru, savukārt zemējuma savienojumu nedrīkst izlaist caur CT.
Neatkarīgi no konkrētā pielietojuma visiem CT trīsfāzu sistēmā ir jāuzrauga strāva vienā virzienā. Ja tiek izmantoti summēšanas CT, pirmais CT ir jāsavieno ar P1 un P2, bet otrais CT jāpievieno summēšanas CT pie P3 un P4. Ir svarīgi, lai visi CT uzraudzītu strāvu vienā virzienā. Sekundārajai ķēdei vienā punktā jābūt iezemētai un jāpārbauda katra CT polaritāte, lai nodrošinātu pareizu gan mērīšanas, gan aizsardzības funkciju darbību.